拟设馆长1名，副馆长2名。

1 办公室：主要负责政务管理、文件起草及运转、人事管理、财务管理、制度建设及对外协调联络，管理艺术品经营中心。

2 展览陈列部：主要负责各类展览、展区陈列的筹划、组织和实施，外展引进和输出的活动组织，年度展览计划的制定与组织实施。

3 学术研究部：主要负责美术创作、美术作品学术研究的策划与组织，收集掌握学术信息及动态，组织开展学术研讨活动。

4 宣教部：主要负责普及推广社会教育培训计划的制定与实施，策划、组织艺术普及性讲座、报告、交流及鉴赏等各类美育活动，以及网络对外宣传。

5 编辑部：内蒙古美术馆编辑部主要负责内蒙古美术馆报与内蒙古美术杂志的编辑工作，并负责馆内展览开幕的拍摄，馆内展览作品的拍摄与资料收集与馆内物料设计。

6 文创中心：内蒙古美术馆文创中心是集艺术商店、艺术书店、咖啡休闲、文创活动、艺术沙龙于一体的综合性文化空间。文创中心定义为艺术衍生品品牌集合地、美术馆文创设计开发实验基地、文创设计品牌展示中心以及艺术衍生品人才培养中心。